Митрополит Сергий (в миру – Виталий Павлович Фомин) родился 24 августа 1949 года в г. Краснозаводске Загорского (ныне Сергиево-Посадского) района Московской области в семье рабочего. По окончании средней школы, в 1967 году, поступил в Московскую Духовную семинарию. В 1970 году окончил семинарию, в 1974 году – Московскую Духовную академию со степенью кандидата богословия за сочинение по кафедре патрологии «Учение святого Афанасия Великого о единодушии Сына Божия с Богом Отцом». В 1973–1974 годах исполнял обязанности заведующего канцелярией МДА и МДС.
26 августа 1973 года наместником Троице-Сергиевой Лавры архимандритом Иеронимом (Зиновьевым; † 1982) пострижен в монашество с именем Сергий в честь преподобного Сергия Радонежского.
21 сентября, в праздник Рождества Пресвятой Богородицы, ректором МДАиС епископом Дмитровским Владимиром (Сабодан) (ныне Блаженнейший митрополит Киевский и всея Украины), рукоположен во иеродиакона, а на следующий день, 22 сентября, – во иеромонаха.
С 1974 по 1977 год – слушатель аспирантуры при МДА. Одновременно в Троице-Сергиевой Лавре исполнял послушание по сопровождению иностранных делегаций, посещающих Лавру.
В 1977 году назначен референтом Отдела Внешних Церковных сношений.
К празднику Святой Пасхи 1978 года Его Святейшеством, Патриархом Пименом удостоен возведения в сан игумена.
В июне 1978 года в Праге участвовал в работе V Всехристианского Мирного Конгресса, на котором был избран членом комитета продолжения работы Христианской мирной конференции (ХМК). Затем избран членом Международного секретариата, заместителем генерального секретаря. В том же месяце, определением Святейшего Патриарха Пимена и Священного Синода, назначен в Прагу представителем Московского Патриархата при ХМК.
К Пасхе 1979 года Святейшим Патриархом Пименом награжден крестом с украшениями; в 1981 году возведен в сан архимандрита.
В апреле – мае 1982 года руководил штабом по подготовке и проведению Всемирной конференции «Религиозные деятели за спасение священного дара жизни от ядерной катастрофы».
16 июля 1982 года Священным Синодом Русской православной церкви назначен заместителем председателя Отдела Внешних Церковных сношений Московского Патриархата с освобождением от должности представителя Русской Православной Церкви при Христианской мирной конференции. Одновременно становится настоятелем Храма Рождества Пресвятой Богородицы в Женеве, при котором и расподагалось данное представительство.
28 декабря 1982 года решением Священного Синода Русской православной церкви избран епископом Солнечногорским, викарием Московской епархии. 29 января 1983 года в Белом зале Патриаршей резиденции в Чистом переулке в Москве состоялось его наречение во епископа, которое возглавил Патриарх Московский и всея Руси Пимен. 30 января 1983 года в Богоявленском патриаршем соборе состоялась его епископская хиротония, которую совершили: Патриарх Пимен, митрополит Таллинский и Эстонский Алексий (Ридигер), митрополит Минский и Белорусский Филарет (Вахромеев), митрополит Крутицкий и Коломенский Ювеналий (Поярков), архиепископ Волоколамский Питирим (Нечаев), архиепископ Свердловский и Курганский Платон (Удовенко), архиепископ Зарайский Иов (Тывонюк).
Принял участие в прошедшей с 24 июля по 10 августа 1983 года VI Генеральной ассамблеи Всемирного совета церквей.
26 декабря 1984 года освобождён от должности заместителя Председателя ОВЦС и назначен представителем Русской Православной Церкви при Всемирном Совете Церквей в Женеве (Швейцария).
9 сентября 1988 года, «во внимание к усердному служению святой Церкви», удостоен сана архиепископа.
31 января 1991 года назначен председателем созданного тогда же Синодального отдела по церковной благотворительности и социальному служению. В том же году не позднее 25 марта освобождён от должности представителя Московского Патриархата при ВСЦ.
По собственному признанию: «Патриарх Алексий II поставил тогда перед нами задачу, чтобы отдел существовал на самофинансировании. Нужно было выживать и искать какие-то дополнительные источники дохода. Но поскольку я работал при Всемирном Совете Церквей, у меня осталось немало связей, необходимых для подобной деятельности. Нашлись помощники — хорошие, добрые христиане, правда, из-за границы, — и с их помощью мы открыли в Москве две пекарни. Благодаря этому удавалось содержать довольно большой коллектив нашего отдела».
17 июля 1996 года решением Священного Синода назначен Управляющим делами Московского Патриархата (в связи с чем по должности стал постоянным член Священного Синода) с сохранением управления Отделом по церковной благотворительности и социальному служению. По собственному признанию: «События происходили важные и интересные: образовывались новые епархии, епархиальные архиереи должны были адаптироваться к новым условиям. Все это было сложно, и моей задачей было „навести мосты“ между местной властью и епархиальными архиереями. Бывало, что местная власть не входила в положение епархии. Слава Богу, приезжая на места, мне удавалось урегулировать эти вопросы».
18 февраля 1997 года в первый день Архиерейского Собора Русской православной церкви 18-23 февраля 1997 года был избран его секретарём.
14 мая 1997 года Распоряжением Президента Российской Федерации включён в состав Совета по взаимодействию с религиозными объединениями при Президенте Российской Федерации.
19 февраля 1999 года Патриарх Московский и всея Руси Алексий II своим указом «во внимание к архипастырским трудам» удостоил архиепископа Сергия сана митрополита.
7 мая 2003 года решением Священного Синода назначен митрополитом Воронежским и Борисоглебским.
5 марта 2010 года решением Священного Синода освобождён от должности председателя Отдела по церковной благотворительности и социальному служению с выражением благодарности за труды по организации Отдела и за руководство его деятельностью на протяжении почти двадцати лет.
26 декабря 2013 года Священный Синод выделил из Воронежской епархии Россошанскую и Борисоглебскую епархии, титул митрополита Сергия был изменён на «Воронежский и Лискинский», все три епархии вошли в состав новообразованной Воронежской митрополии, главой которой стал митрополит Сергий.
В настоящее время митрополит Сергий – Правящий Архиерей Воронежской епархии Русской Православной Церкви, Священноархимандрит Свято-Успенского Дивногорского монастыря. Помимо архипастырского окормления приходов и монастырей епархии, Владыка Сергий выстраивает гармоничные отношения с государственной властью и светским обществом; принимает деятельное участие в решении вопросов, связанных с воспитанием молодежи и образованием; уделяет серьезное внимание социальному служению приходов и духовенства епархии.